Nach seiner Gründung 1980 und zwei umfangreichen Erweiterungen in den Jahren 2005 und 2017, umfasst der Naturpark heute 56 Gemeinden und Städte in vier Landkreisen: Sigmaringen, Tuttlingen, Zollernalbkreis und Biberach. Sigmaringen hat mit 47% den größten Anteil, Tuttlingen den zweitgrößten mit 39%, gefolgt vom Zollernalbkreis mit 12%. Der kleinste Anteil entfällt auf Biberach, mit einem Anteil von ca. 2% der Fläche.
Die Mitglieder des Naturparks Obere Donau bekennen sich zu ihrer Verantwortung für Mensch und Natur. Sie stellen daher die nötigen Ressourcen für den Naturpark und die Arbeit seiner Verwaltung zur Verfügung. Eine breite Mitarbeit der Bevölkerung ist ausdrücklich erwünscht und wird nach Kräften gefördert.
Verbände
Regionalverband Bodensee-Oberschwaben
Regionalverband Neckar-Alb
Regionalverband Schwarzwald-Baar-Heuberg
Landesnaturschutzverband Baden-Württemberg
Landesbauernverband Baden-Württemberg
Badischer Landwirtschaftlicher Hauptverband e.V.
Forstkammer Baden-Württemberg
Landesverband Baden-Württemberg des DAV
Bergwacht Sigmaringen
Schwäbischer Albverein
Landessportverband Baden-Württemberg Referat Sport und Umwelt
Aktion Ruinenschutz Oberes Donautal e.V.
Deutscher Alpenverein
Regierungspräsidium Freiburg
Referat 84